Wenn es nur darum geht die DTS Tonspur zu ersetzen und möglichst wenig Probleme mit anderen Abspielgeräten zu haben würde ich auf AC3 setzen.
Da ich das ganze Galama satt hatte und alle TV ARC nutzen:
AC3 5.1 mit 384kbps
Dank Mietwohnung und Nachwuchs habe ich keine riesen Anlage und bin mit dem Ergebnis mehr als zufrieden.
Encoden mache ich per Batch mit ffmpeg - das dürfte auch das Tool sein das bei dem meisten Video Konvertern eh im Hintergrund werkelt