Schwierig zu beantworten.
Auf meinem NAS laufen produktive Server, die jederzeit errichbar sein sollen. Gleichzeitig läuft ein JD2. Der muss auch erreichbar sein, über my.jdownloader.org.
Gleichzeitig wählt sich diese Maschine bei Perfect-Privacy über einen SSH Tunnel ein und sämtliche Downloads laufen darüber (Port 22).
Das ist eine Port abhängige Geschichte.
Deine Absichten werden jedoch über URLs definiert. Ich denke, dass man das nicht mit dem JD, oder einem anderen Downloadmanager hinbekommt.
Das dürfte nur über das Betriebssystem gehen. Du wirst wohl ein S.c.r.i.p.t erstellen müssen, das die DNS Abfragen überwacht und dementsprechend das Routing über einen Proxy leitet, oder eben nicht.
Ich kenne so ein S.c.r.i.p.t nicht, aber vielleicht hilft Dir ja folgende Seite etwas weiter:
https://www.shellhacks.com/linux-pro...-command-line/