DU musst für Pokemon den Speichertyp auf FLASH 512KBYTES einstellen.
Das kannste bei No$GBA in den Einstellungen machen. Andere Spiele brauchen manchmal andere Speichertypen da musste aufpassen , wenn du den falschen hast kannste dein Spiel entweder gar net erst starten oder nicht im Spiel abspeichern.
Warum es bei dir nachher doch ging ist wohl so zu erklären das es normale No$GBA Emus gibt mit Default settings wo man den Speichertyp noch einstellen muss , und solche , wo die Einstellungen schon vorgenommen wurden. Letzteren hattest du dann wohl zum Glück erwischt
Greetz