Der Unterschied ist vor allem die "Update Politik". Die einen laufen zb noch auf 2.6er Kernel, andere auf 3.0 oder 3.5.
Selbiges bei den Paketen, bei einem bekommst du gut durchgetestete Versionen dafür nicht grad die aktuellsten. Bei anderen bekommst du schnell aktuelle Updates, hast dafür mehr Potential das Fehler darin sind usw...
Kannst dir natürlich auch deine eigene Distribution basteln indem du dir selbst nen Kernel kompilierst und dann alles selbst machst