Du hast deine Daten nicht intern, sondern für die externe Ansicht verschlüsselt. Du nutzt sicherlich ein Dualbootsystem, nicht wahr? (Also Mint und - beispielsweise - eine Windows- Partition)
Du kannst Problemlos von Linux auf deine "alten" Windowsordner und Dokumente zugreifen, nicht jedoch von Windows auf Linux. Unter Windows erscheint deine Linuxpartition nicht in der Laufwerktabelle und ist somit "verschlüsselt".
Leider haben die Dev's von den Ubuntu-/Debianbasierten Distributionen hier das falsche Wort gewählt. "Verstecken" hätte es da eher getroffen.
Ich würde dir raten, nachdem du dein System aufgesetzt hast, immer sofort eine TrueCrypt- Verschlüsselung vorzunehmen. Sofern du Zugriff auf eine Externe HDD hast, solltest du einfach diese Verschlüsseln, diese Festplatte möglichst nur dann anschließen wenn die Dateien gebraucht werden und ansonsten kaum sensible Daten auf dem PC selbst zuzulassen.
Ich hoffe, das hilft dir ein wenig weiter.
Letzter Tipp noch:
Sofern du, wie erwähnt, zwei OS' nutzt, solltest du dich im Vorfeld schlau machen, ob das jeweilige TrueCrypt auf dem selben Stand ist, da du sonst evtl. nur über ein OS Zugriff auf die Daten hast, die du verschlüsselst.
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