[PushUp]

Eben nicht!!!

Wenn Du per Drag & Drop mit iFunBox aus dem "Installous" Ordner die *.ipa (der Übersicht wegen evtl. auch die Bilddatei dazu *.png) herauskopiert hast und für die Zukunft für die erneute Verwendung auf dem PC sicherst, kannst/musst Du den kompletten Ordner leeren!
Damit sind natürlich auch auf dem iPad die Daten entfernt und Du hast den benötigten Platz geschaffen.
Jetzt brauchst Du bei iFunBox nur auf den obersten Button "Install App" klicken, worüber Du auf der Festplatte Deine Datei anwählst und über das Programm installieren lässt - damit hat das iPad als solches nix zu tun!

Damit das fehlerfrei funktioniert, musst Du natürlich auch aus Cydia:

+ afc2add (USB-Erkennung über iFunBox), i.V.m. AppSync
+ AppSync for iOS 5.0+ (USB-Erkennung über iFunBox), i.V.m. afc2add

installiert haben - das war`s!

Wie oben geschrieben, klappt es manchmal besser mit Version 1.7 oder 1.9 - das muss man halt testen!